Cyanobacteria are common in aquatic environments but are also well-adapted to terrestrial habitats where they are represented by a diversified flora. The present study aimed to contribute to our taxonomic knowledge of terrestrial cyanobacteria by way of a floristic survey of the main components of corticolous communities found in seasonal semideciduous forest fragments. Samples of visible growths of Cyanobacteria, algae, and bryophytes found on tree bark were randomly collected and their taxonomies examined. Eighteen species of Cyanobacteria were found belonging to the genera Aphanothece, Chroococcus, Lyngbya, Phormidium, Porphyrosiphon, Hapalosiphon, Hassalia, Nostoc, Scytonema, and Stigonema. Many genera and species observed in the present work have been reported in previous surveys of the aerophytic flora in several regions of the world, although six species were described only on the basis of populations found in the forest fragments studied, which highlights the importance of taxonomic studies of cyanobacteria in these habitats.

Espécies de Rhodophyta de 10 Unidades de Conservação da região Sul do Brasil foram investigadas. As amostragens foram conduzidas em 105 segmentos de riachos consistindo em transeções de 10 m de comprimento. O levantamento florístico resultou em 80 populações representando três gêneros, Batrachospermum, Kumanoa e Hildenbrandia, além do estágios 'Chantransia'. Batrachospermum foi representado por cinco espécies (B. arcuatum Kylin, B. atrum (Hudson) Harvey, B. helminthosum Bory, B. keratophytum Bory, B. puiggarianum Grunow in Wittrock & Nordstedt). O gênero Kumanoa foi representado por K. abilii (Reis) Necchi Júnior & Vis e K. ambigua (Montagne) Entwisle et al., enquanto Hildenbrandia exclusivamente por H. angolensis W. West & G.S. West. Nossos resultados confirmam Batachospermum como o gênero melhor representado, em termos de número de espécies, entre as Rhdophyta de água doce. Batrachospermum arcuatum foi registrado pela primeira vez na região Sul do Brasil, ampliando assim, o limite austral de sua distribuição.

Species of Rhodophyta from 10 Conservation Units from the south region of Brazil were surveyed. The samplings were carried out in 105 stream reaches, consisting of 10 m length transects. The floristic survey involved 80 populations, representing three genera, Batrachospermum, Kumanoa and Hildenbrandia plus the 'Chantransia' stages. Batrachospermum was represented by five species (B. arcuatum Kylin, B. atrum (Hudson) Harvey, B. helminthosum Bory, B. keratophytum Bory and B. puiggarianum Grunow in Wittrock & Nordstedt). The genus Kumanoa was represented by K. abilii (Reis) Necchi Júnior & Vis and K. ambigua (Montagne) Entwisle et al., while Hildenbrandia only by H. angolensis W.West & G.S.West. Our results confirm Batachospermum as the best represented genus, in terms of species number, among freshwater Rhdophyta. B. arcuatum was a new record for the south region of Brazil, thus extending its austral distribution range.

Algas e cianobactérias podem colonizar uma grande variedade de ambientes terrestres e a composição florística das comunidades desses habitats é praticamente desconhecida. Durante o estudo das algas e cianobactérias aerofíticas de fragmentos florestais na região noroeste do estado de São Paulo, seis populações de cianobactérias não puderam ser identificadas em nível específico e, após estudos morfológicos e métricos, revelaram-se novos morfotipos para a Ciência. Quatro desses pertencem ao gênero Aphanothece (A. excentrica, A. coacervata, A. densa e A. vaginata), um a Phormidium (P. arboricola) e um a Hapalosiphon (H. santannae). Este estudo apresenta a descrição, comparação e proposição das novas morfoespécies e contribui com o conhecimento da diversidade do grupo.

Algae and Cyanobacteria can colonize a wide variety of terrestrial environments and the assemblages from aerophytic habitats are very poorly known. During the survey of aerophytic algal and cyanobacterial communities in forest fragments in northwestern São Paulo state, six cyanobacteria populations could not be identified at species level and, after morphological and metrical analysis, proved to be new morphotypes to Science. Four belong to the genus Aphanothece (A. excentrica, A. coacervata, A. densa and A. vaginata), one to Phormidium (P. arboricola) and one to Hapalosiphon (H.santannae). This study presents the description, comparison and proposition of the new morphospecies and improves taxonomic knowledge of the diversity of the group.

Este estudo objetivou avaliar a taxonomia no nível específico e as relações filogenéticas entre as espécies de Thorea do Brasil e de outras regiões do mundo usando dois marcadores moleculares - genes plastidial da subunidade grande da RUBISCO (rbcL) e nuclear da subunidade pequena do DNA ribossômico (SSU rDNA). Três amostras de Thorea do Brasil (Estados de Mato Grosso do Sul e São Paulo) e uma amostra da República Dominicana (RD) foram sequenciadas. Análises baseadas nas sequências parciais de rbcL (1.282 pb) e completas de SSU (1.752 pb) foram essencialmente congruentes e revelaram que Thoreales formou um clado monofilético distinto, que teve dois ramos principais com alto suporte, representando os gêneros Thorea e Nemalionopsis. O clado de Thorea teve quarto ramos principais com alto suporte em todas análises, cada um representando as espécies: 1) T. gaudichaudii C. Agardh da Ásia (Japão e Filipinas); este clado ocorreu apenas nas análises de rbcL; 2) T. violacea Bory da Ásia (Japão) e América do Norte (E.U.A. e RD); 3) T. hispida (Thore) Desvaux da Europa (Inglaterra) e Ásia (Japão); 4) um grupo distinto com as três amostras do Brasil (identidade das sequências: rbcL 97,2%, 1.246 pb; SSU 96,0-98,1%, 1.699-1.720 pb). As amostras brasileiras formaram claramente um clado monofilético baseado nos dois marcadores moleculares e foi interpretado como uma espécie distinta, para a qual restabelecemos o nome T. bachmannii Pujals. Evidências morfológicas e moleculares indicam que Thoreales é bem resolvida nos níveis ordem e gênero. Em contrapartida, as espécies de Thorea reconhecidas por dados moleculares requerem caracteres adicionais (p.ex. reprodutivos e números de cromossomos) para permitir circunscrição taxonômica consistente e confiável visando revisão mundial baseada em evidências moleculares e morfológicas.

This study aimed to evaluate species level taxonomy and phylogenetic relationship among Thorea species in Brazil and other regions of the world using two molecular markers - RUBISCO large subunit plastid gene (rbcL) and nuclear small-subunit ribosomal DNA (SSU rDNA). Three samples of Thorea from Brazil (states of Mato Grosso do Sul and São Paulo) and one sample from Dominican Republic (DR) were sequenced. Analyses based on partial sequences of rbcL (1,282 bp) and complete sequences of SSU (1,752 bp) were essentially congruent and revealed that Thoreales formed a distinct monophyletic clade, which had two major branches with high support, representing the genera Thorea and Nemalionopsis. Thorea clade had four main branches with high support for all analyses, each one representing the species: 1) T. gaudichaudii C. Agardh from Asia (Japan and Philippines) - this clade occurred only in the rbcL analyses; 2) T. violacea Bory from Asia (Japan) and North America (U.S.A. and DR); 3) T. hispida (Thore) Desvaux from Europe (England) and Asia (Japan); 4) a distinct group with the three Brazilian samples (sequence identity: rbcL 97.2%, 1,246 bp; SSU 96.0-98.1%, 1,699-1,720 bp). The Brazilian samples clearly formed a monophyletic clade based on both molecular markers and was interpreted as a separate species, for which we resurrected the name T. bachmannii Pujals. Morphological and molecular evidences indicate that the Thoreales is well-resolved at ordinal and generic levels. In contrast, Thorea species recognized by molecular data require additional characters (e.g. reproductive and chromosome numbers) to allow consistent and reliable taxonomic circumscription aiming at a world revision based on molecular and morphological evidences.

As algas habitam uma grande variedade de ambientes e substratos terrestres; entretanto o conhecimento taxonômico para as regiões tropicais ainda é escasso. Esse levantamento foi conduzido em 10 fragmentos florestais no Estado de São Paulo, onde crescimentos visíveis de algas e briófitas foram coletados e os principais componentes da comunidade algal foram estudados. Os resultados revelaram a ocorrência de nove espécies de algas verdes, distribuídas nas classes Trebouxiophyceae (uma espécie), Charophyceae (uma espécie) e Ulvophyceae (sete espécies). Desmococcus olivaceus (Persoon ex Archerson) J. R. Laundon e Printzina effusa (Krempelhüber) Thompson & Wujek são novos registros para o Brasil. Os organismos mais frequentes nas áreas pertencem a Trentepohliales, que foi representado principalmente por espécies de Trentepohlia . Baseado nos resultados encontrados, é recomendado que tais comunidades recebam mais atenção em investigações futuras para aumentar o conhecimento sobre esse importante grupo de produtores primários.

The algae inhabit a wide variety of terrestrial environments and substrates; however the taxonomic knowledge for tropical regions is still scarce. This survey was conducted in ten forest remnants in São Paulo State where visible growths of algae and bryophytes were collected and studied for the main algal components of the communities. Results reveal the occurrence of nine species of green algae, distributed through the class Trebouxiophyceae (one species), Charophyceae (one species) and Ulvophyceae (seven species). Desmococcus olivaceus (Persoon ex Archerson) J. R. Laundon and Printzina effusa (Krempelhüber) Thompson & Wujek are new records for Brazil. The most frequent organisms found in the areas pertain to Trentepohliales that is mainly represented by Trentepohlia species. On the basis of results found, it is recommended that such communities receive more attention in future investigations to improve the knowledge about this important group of primary producers.

Este estudo visou: descrever um evento de sucessão ecológica em curto período (70 dias) da comunidade de macroalgas após distúrbio artificial (remoção); avaliar se as características da estrutura da comunidade foram semelhantes antes e depois do período experimental; comparar o processo sucessional em dois trechos experimentais (parcialmente e totalmente perturbados, TPP e TTP), simulando distúrbios de médio (parcial) e grande impacto (completa remoção). Com relação ao tempo de colonização, Oedogonium sp. foi classificada como sucessional indiferente, enquanto Chaetophora elegans (Roth) C. Agarth e Batrachospermum delicatulum (Skuja) Necchi et Entwisle como sucessionais tardias para TTP; para TPP a única diferença foi que Oedogonium sp. foi classificada como sucessional tardia. Temperatura foi a variável mais influente para a maioria das espécies e variáveis biológicas, com aumentos de temperatura provavelmente favorecendo taxas de reprodução. Quanto à estratégia de vida Oedogonium sp. foi classificada como estrategista C-S, enquanto B. delicatulum e C. elegans como estrategistas S para os dois trechos. De maneira geral, a recuperação da estrutura da comunidade não foi completa ao final do período de sucessão. Este estudo de curto período foi consistente com o processo de sucessão determinístico, pois a trajetória de sucessão foi previsível, porque riqueza e abundância de espécies, formas de crescimento e estratégias de vida seguiram um padrão definido.

This investigation aimed to describe a short term (70 days) ecological succession event of a macroalgal community in a stream from northwestern São Paulo state (20º43'S; 49º13'W) after artificial disturbance (removal); evaluate if community structure characteristics were similar before and after the experimental period; compare the successional process of two experimental stream segments (partly and completely disturbed segments, PDS and CDS, respectively), simulating medium (partial) and high impact (complete removal) disturbances. In terms of colonization time, Oedogonium sp. was classified as successionally indifferent, whereas Chaetophora elegans (Roth) C. Agarth and Batrachospermum delicatulum (Skuja) Necchi et Entwisle were classified as late successional forms for CDS; for PDS the only difference was that Oedogonium sp. was classified as late successional. In terms of successional strategy, Oedogonium sp. was classified as a C-S strategist, whereas C. elegans and B. delicatulum were regarded as S strategists for both stream segments. Temperature was the most influential variable for most species and biological variables, with temperature increases probably favouring reproduction rates. In general, community structure recovery was not complete at the end of succession. This short-term study was consistent with the deterministic process of succession, since the succession trajectory was predictable, because species richness and abundance, growth forms and life strategies followed a definite pattern.

Estudos florísticos das comunidades de macroalgas lóticas no Brasil são quase que exclusivamente baseadas em material do Estado de São Paulo. Informações sobre macroalgas de riachos são virtualmente ausentes no Estado do Paraná. Considerando a carência de trabalhos sobre estes importantes produtores primários de ambientes lóticos, foi realizado um estudo mais amplo, a fim de conhecer melhor a biodiversidade das comunidades de macroalgas no Paraná. Neste contexto, o presente trabalho teve como objetivo realizar o levantamento florístico das comunidades de macroalgas da Floresta Nacional de Irati (Flona de Irati), uma unidade de conservação que protege uma área de Floresta Ombrófila Mista (Mata de Araucária). Os estudos foram desenvolvidos em 11 riachos, através de duas coletas realizadas durante os períodos de 19-21 de julho/2005 e 2-4 de fevereiro/2006. Em cada riacho foi estabelecido um segmento de 10 metros de extensão, no qual foi realizado o exame visual detalhado do substrato a fim de determinar a presença de macroalgas. Além da presença das macroalgas, as seguintes variáveis ambientais foram medidas em cada data de amostragem: temperatura, turbidez, condutividade específica, pH, oxigênio dissolvido, profundidade, nutrientes, cor da água e demanda química de oxigênio (DQO). O levantamento taxonômico resultou na identificação de 23 táxons e mostrou a dominância, em termos de número de táxons, de Chlorophyta sobre as demais divisões. O gênero Phormidium Kützing ex Gomont foi o único representado por mais de uma espécie. De modo geral, a maioria das espécies encontradas na Flona de Irati tem sido reportada em estudos prévios, entretanto, uma parte significativa das macroalgas inventariadas foi formada por táxons de ocorrência rara em riachos brasileiros ou, até mesmo, prováveis novidades para a ciência.

Surveys of stream macroalgal communities in Brazil are almost exclusively based on data from São Paulo State. There are no extensive studies concerning stream macroalgae in Paraná state. Having in mind the scarcity of works treating these important primary producers in lotic ecosystems, a more comprehensive study was carried out in order to increase our knowledge of stream macroalgal community biodiversity in Paraná state. In this context, the main objective of this study was to do a floristic survey of stream macroalgal communities in Irati National Forest (INF), a protected area of Mixed Ombrophilous Forest (Araucaria Forest). Eleven streams were sampled in 2005 (July 19-21) and 2006 (February 2-4). In each stream, a 10-meter cross-transect was established in which a detailed visual examination took place to determine the presence of macroalgae. In addition, the following environmental variables were measured at each sampling date: temperature, specific conductance, pH, dissolved oxygen, depth, nutrients, water colour and chemical oxygen demand (COD). The floristic survey resulted in the identification of 23 taxa and showed the dominance of Chlorophyta over other algal divisions. Only the genus Phormidium Kützing ex Gomont was represented by more than one species. In general, the majority of species found at Irati National Forest have been reported in previous studies; however, a significant portion of the macroalgae was composed of taxa that rarely occur in Brazilian streams or they may be new to science.

O Parque Nacional de Itatiaia (PNI) inclui duas formações vegetais brasileiras em seus limites: floresta pluvial tropical atlântica (MA) e campos de altitude (CA). Foram amostrados 14 pontos, sete em cada formação vegetal, em duas estações do ano (verão e inverno). Foram encontradas 29 espécies de macroalgas, sendo 15 espécies em MA e 19 espécies em CA, com apenas cinco espécies em comum. A riqueza de espécies por ponto de amostragem variou de 1 a 7 (2,9 ± 2,0), o índice de diversidade de Shannon-Wiener (H') de 0 a 0,94 (0,24 ± 0,26) e a cobertura percentual de 0 a 35% (14,0 ± 12,5%). Estes valores situaram-se dentro da amplitude reportada em trabalhos prévios sobre macroalgas lóticas. A análise de regressão múltipla revelou que as variações de temperatura explicaram 39,2% da variação da abundância e 35,5% da riqueza de espécies a ainda que 54,8% da variação da diversidade foi explicada por Demanda Química de Oxigênio (DQO) e pH. Análise de grupamento das comunidades de macroalgas do PNI não agrupou pontos das mesmas regiões (MA e CA). Análise de Componentes Principais separou claramente os pontos amostrados das regiões de MA e CA, bem como das estações do ano estudadas (inverno e verão), influenciados mais fortemente pela temperatura, sombreamento, pH, altitude, potássio e DQO. Os padrões gerais de distribuição em mosaico e dominância por poucas espécies descritos para comunidades de macroalgas lóticas foram corroborados pelos dados do PNI, sugerindo que parecem ser universais para tais comunidades.

Itatiaia National Park (INP) includes two kinds of Brazilian vegetation within its limits: Atlantic tropical rainforest (AF) and highland grassland (HG). Fourteen sites were sampled, seven in each region (AF and HG), in two seasons (summer and winter). Twenty nine species of macroalgae were surveyed, from which 15 in AF and 19 in HG, with only five species in common. Species richness per sampling site ranged from 1 to 7 (2.9 ± 2.0), Shannon-Wiener diversity index (H') from 0 to 0.94 (0.24 ± 0.26) and percent cover from 0 to 35% (14.0 ± 12.5%). These values fitted within the range reported in previous studies on lotic macroalgae. Multiple regression analysis revealed that temperature variations accounted for 39.2% of abundance and 35.5% of species richness variations and also that 54.8% of diversity variations were explained by variations of Chemical Oxygen Demand (COD) and pH. Cluster analysis of macroalgal communities of INP did not group sites from the same regions (AF and HG). Principal Component Analysis clearly separated the sampling sites of the two regions, as well as of the two seasons (summer and winter), mostly influenced by temperature, shading, pH, altitude, potassium and COD. The general patterns of patchy distribution and dominance by few species described for lotic macroalgal communities were corroborated by data from INP, suggesting that they seem to be universal for such communities.

Foram analisados três pontos em cada uma das três seguintes regiões tropicais: 1) região Noroeste do Estado de São Paulo, representando região degradada; 2) região de Bonito, Mato Grosso do Sul, representando ambiente de águas duras; e 3) região de Ubatuba, litoral Norte de São Paulo, ambiente de Mata Atlântica bem preservado. A região de águas duras apresentou maiores valores médios de riqueza de espécies de macroalgas e índices de diversidade (6,3 espécies por ponto e H' = 0,62). As regiões Noroeste e de Mata Atlântica apresentaram maiores valores médios de cobertura percentual (22,5% e 17,0%, respectivamente). Em todos os pontos da região noroeste ocorreu uma ou duas espécies dominantes (com cobertura percentual significativamente maior que as demais), o que caracteriza o padrão de distribuição do tipo pré-ocupação de nicho. O mesmo padrão foi encontrado para dois pontos da região de mata Atlântica. Na região de águas duras foi verificada dominância de uma espécie em dois dos três pontos amostrados, mas ao contrário da região noroeste, os valores de sobreposição de nicho foram menores, evidenciando o padrão de distribuição em mosaico. A competição por espaço é um dos principais fatores que explica a distribuição espacial. De forma geral, ambientes com o padrão do tipo pré-ocupação de nicho apresentaram baixa riqueza de espécies, altos valores de sobreposição e largura de nicho, alta cobertura percentual para as espécies dominantes e altos valores para o índice de dominância. Em contrapartida, ambientes com o padrão de distribuição em mosaico apresentaram alta riqueza de espécies, baixos valores de largura e sobreposição de nicho, baixa cobertura percentual e baixo índice de dominância.

Three sampling sites were analysed in each of the following tropical regions: 1) northwestern São Paulo State, representing a disturbed region; 2) Bonito, Mato Grosso do Sul State, representing a hard water region; and 3) Ubatuba, northern costal region of São Paulo State, a well preserved tropical rainforest region. The hard water region had the highest mean values for macroalgal species richness (6.3) and diversity index (H' = 0.62). Northwest and rainforest regions had the highest percent cover values (22.5% and 17.0%, respectively). All sites in the northwest region had one or two dominant species (percent cover significantly higher than the remaining species), characterizing the niche pre-emption distribution pattern. The same pattern was found in two sites of the Atlantic rainforest. The hard water region had dominance of one species in two out of the three sites, but differently from the northwest region, niche overlap values were lower, evidencing a patch distribution. Competition for space was one of the main factors to explain spatial distribution. Overall, sites characterized by niche pre-emption had lower species richness, higher values for niche width and overlap, dominance index and percent cover of dominant species. In contrast, sites characterized by patch distribution had higher species richness and lower values for niche overlap and width, dominance index and percent cover.

Seis populações da alga vermelha Batrachospermum delicatulum (Skuja) Necchi & Entwisle, incluindo gametófito e estágio 'Chantransia', foram analisadas em condições de campo e cultura aplicando as técnicas de fluorescência da clorofila e oxigênio dissolvido. Parâmetros derivados das curvas fotossíntese-irradiância indicaram adaptação a baixa irradiância em todas populações, que foi caracterizada por fotoinibição, baixos valores de Ik e Ic e altos valores de a. Dados de ambas técnicas revelaram diferenças significativas entre populações e fases para a maioria dos parâmetros. A fotossíntese também respondeu diferentemente a variações de temperatura em cada população, com taxas semelhantes sob ampla faixa de temperatura. Nenhum padrão consistente foi encontrado quando a mesma população ou fase foi testada, sugerindo alta capacidade para ajustar o aparato fotossintético a distintas condições de temperatura e irradiância. Experimentos de pH mostraram tendência decrescente sob pH mais alto ou taxas maiores em pH 6,5 sugerindo, respectivamente, maior afinidade por carbono inorgânico como CO2 ou uso indistinto de bicarbonato e CO2. O padrão de variação diurna observado concorda com o de macroalgas marinhas e algumas rodófitas continentais, consistindo de dois picos: o primeiro (geralmente maior) durante a manhã e o segundo (tipicamente menor) à tarde. As características fotossintéticas de B. delicatulum (Skuja) Necchi & Entwislemostraram amplas respostas à irradiância, temperatura e pH/carbono inorgânico, refletindo sua ampla tolerância à estas variáveis, que provavelmente contribui para sua ampla distribuição espacial e temporal.

Six populations of the freshwater red alga Batrachospermum delicatulum (Skuja) Necchi & Entwisle, including gametophyte and 'Chantransia' stage, were analysed in culture and natural conditions applying chlorophyll fluorescence and oxygen evolution. Parameters derived from the photosynthesis-irradiance curves indicated adaptation to low irradiance for all populations, which was characterized by photoinhibition, low values of Ik and Ic and high values of a. Data from both techniques revealed significant differences among populations and phases for most photosynthetic parameters. Similarly, photosynthesis responded differently to variations in temperature in each population with similar rates under a wide range of temperature. No consistent pattern was found when the same population or phase was tested, suggesting high capacity to adjust the photosynthetic apparatus to distinct conditions of irradiance and temperature. pH experiments showed a decreasing trend towards higher pH or higher rates at pH 6.5, suggesting, respectively, higher affinity to inorganic carbon as CO2 or indistinct use of bicarbonate and CO2. The diurnal pattern of photosynthesis essentially agree with that for seaweeds and freshwater red algae, consisting of two peaks: a first (generally higher) during the morning and a second (typically lower) in the afternoon. Photosynthetic characteristics of B. delicatulum (Skuja) Necchi & Entwisleexhibited a wide range of responses to irradiance, temperature and pH/inorganic carbon, reflecting its wide tolerance to these variables, which probably contributes to its wide spatial and temporal distribution.

Cento e setenta e dois trechos de riachos de seis regiões naturais (partes de biomas ou áreas geológicas) no estado de São Paulo (Mata Atlântica, Cerrado, regiões de Águas Duras, região noroeste do estado, Floresta Subtropical e Floresta Tropical) foram investigados com relação às Cyanophyceae macroscópicas mais representativas nas comunidades algais. Condutividade, velocidade da correnteza, saturação de oxigênio, pH, turbidez e temperatura foram os parâmetros ecológicos analisados para a avaliação da distribuição dos táxons entre os segmentos de riachos. A abundância das populações foram avaliadas através de suas porcentagem de cobertura. Trinta e quatro táxons foram identificados, sendo que Phormidium retzii foi a espécie melhor distribuída no estado, ocorrendo em todas regiões estudadas, exceto em regiões de águas duras e sua ocorrência revelou correlação negativa com condutividade. Na região de floresta subtropical foi encontrada a maior riqueza média de espécies por trecho amostrado, enquanto nas regiões de floresta tropical foram observados os mais elevados valores de abundância de algas azuis. Testes de correlação revelaram que a condutividade foi significativa e negativamente relacionada às variações na abundância e riqueza das espécies de algas azuis. Este resultado provavelmente reflete a habilidade das cianofíceas em desenvolver-se em ambientes com média a baixa concentração de íons e, ao mesmo tempo, ter vantagens sob condições de estresse de nutrientes.

A hundred seventy two stream reaches from six distinct natural regions (parts of biomes or geological areas) in São Paulo State (Atlantic Rainforest, Cerrado, Hard Water regions, Northwest region, Subtropical Rainforest, and Tropical Rainforest) were searched for the most representative macroscopic Cyanophyceae of phytobenthic communities. Selected ecological parameters were analyzed in each stream segment: conductance, current velocity, oxygen saturation, pH, turbidity, and water temperature. Algal abundance was evaluated as percentage cover. Thirthy four cyanophyte taxa were identified and Phormidium retzii was the most widespread species throughout the State, occurring in all studied regions, except in hard water areas, and was negatively correlated to conductance. The subtropical Rainforest region presented the highest mean species richness per site, whereas the tropical Rainforest region had the highest abundance (percentage cover) of blue-green algae. Correlation tests revealed that conductance was significantly and negatively related to variations in abundance and richness of cyanophyte in streams of São Paulo State. This relationship probably reflects the ability of blue-green algae to grow at medium to low ion content and to take advantage under nutrient stress conditions.